FlowJo v10 - Niveau intermédiaire

• Stage
•   Actions régionales
•   Techniques spécifiques
•    ISCACHE Anne-Laure

Objectifs

• Revoir et maitriser les outils de base de FlowJo pour l’analyse de données de cytométrie en flux.
• Connaitre et comprendre les outils avancés de FlowJo pour des analyses complexes de cytométrie en flux (analyses multiparamétriques ou expériences de variables multiples patients, dates, …..)
• Connaitre et comprendre les outils de compensation de FlowJo et savoir modifier les échelles

Public

Chercheurs et ingénieurs et techniciens qui utilisent FlowJo régulièrement pour leurs analyses de cytométrie en flux

Les agents non CNRS doivent demander au préalable l’accord de leur employeur pour la prise en charge financière (180 € à 220 € selon le nombre de participant)

Pré-requis

Avoir une bonne pratique et compréhension de la cytométrie en flux.
Maîtriser les principes de compensation.

Programme

Présentation générale du logiciel

Outils Avancés
- Organisation et annotation de l’expérience (groupes ; métadonnées ; mots clés)
- Création de rapports statistiques complexes – options d’affichage des résultats
- Création de rapports graphiques complexes – options d’affichage des résultats

Outils d’analyse multicouleurs : Compensation
Réaliser une matrice de compensation (méthode manuelle ou assistée)
Détecter /Modifier une matrice de compensation
Modifier les échelles d’affichage des données

Méthodes pédagogiques

Partie théorique réalisée en cours magistral à l’aide d’un support tutoriel remis aux participants lors de la présentation du logiciel le matin. La partie pratique est réalisée sur poste informatique avec remise de différents fichiers de données l’après-midi. Les exercices reprennent les différents points abordés au cours de la partie théorique. Analyse de données des stagiaires (Les stagiaires peuvent se munir d’une clé avec leurs fichiers (fcs3.0) de cytométrie pour les analyser au cours de la formation)
Exercices pratiques sur PC (version 10 FlowJo)