Analyse d'images automatique avec Image J sous OMERO

  • Stage
  •   Actions régionales
  •   Techniques spécifiques
  •    BRAU Frédéric , BOUDIER Thomas

Objectifs

• Programmation de macro-fonctions : Notions d’algorithmique, variables, opérateurs, bibliothèque de Macro-fonctions
• TAPAS : un langage macro modulaire

Programme

Jour 1 : Fiji-OMERO Batch plugin
Présentation OMERO.parade
Présentation et installation du Batch OMERO plugin
Langage macro et OMERO extensions

Analyse sur cas pratiques

Jour 2 : Fiji-OMERO-TAPAS
Présentation générale outil TAPAS. Installation et premier script.

Scripts pour la segmentation et les mesures.

Sessions à venir 1

  • Analyse d’images automatique avec ImageJ/Fiji sous OMERO

  •    CNRS Délégation Côte d'Azur
  •    Salle informatique
  •    14 heure(s) sur 2 jour(s)
  •   09H00 - 17H00
  •   12 inscriptions max.
  •   
  • Clôture des inscriptions il y a 6 jours
Inscriptions closes

Partenaires

CNRS

Informations pratiques

Formation DR20 CNRS
250 RUE ALBERT EINSTEIN - BÂTIMENT 3
06 905 SOPHIA ANTIPOLIS CEDEX
  04 92 96 03 39