Analyse d'images automatique avec Image J sous OMERO [ ANNULEE ]

• Stage
•   Actions régionales
•   Techniques spécifiques
•    BRAU Frédéric , BOUDIER Thomas

Objectifs

• Programmation de macro-fonctions : Notions d’algorithmique, variables, opérateurs, bibliothèque de Macro-fonctions
• TAPAS : un langage macro modulaire

Programme

Jour 1 : Fiji-OMERO Batch plugin
Présentation OMERO.parade
Présentation et installation du Batch OMERO plugin
Langage macro et OMERO extensions

Analyse sur cas pratiques

Jour 2 : Fiji-OMERO-TAPAS
Présentation générale outil TAPAS. Installation et premier script.

Scripts pour la segmentation et les mesures.