Analyse d'images automatique avec Cell Profiler [ ANNULEE ]

• Stage
•   Actions régionales
•   Techniques spécifiques
•    ABELANET Sophie

Objectifs

Cell profiler : un logiciel d’analyse d’images tourné vers l’analyse haut débit, pas d’utilisation de langage de programmation mais notions en analyse d’images essentielles

Pré-requis

Important -
prérequis minimum : base de l’analyse d’images de la session 2

Programme

J1 : Notions de base sur Cell Profiler

Découverte du logiciel
Installation et tutoriels
Gestion des fichiers propriétaires
Création d’un projet et gestion des pipelines
Export de données

Exercices

J2 : Cas pratiques

mise en place de « pipelines » sur les images des participants.

Méthodes pédagogiques

Exercices & cas pratiques