Logiciel R : Initiation

• Stage
•   Actions régionales
•   Techniques spécifiques

Objectifs

Cette formation s'adresse à des personnes souhaitant prendre en main le logiciel R : son interface, sa syntaxe, ses objets afin que le stagiaire devienne autonome dans le traitement de ses données. Il ne s’agit donc pas d’une formation sur la méthodologie statistique mais bien d’une formation sur le logiciel R. De même, il ne s’agit pas d’une formation sur les techniques de programmation avancée sous R.

Public

Les agents non CNRS doivent demander au préalable l’accord de leur employeur pour la prise en charge financière (entre 300 € et 450 € HT selon le nombre de participants).

Pré-requis

• Connaissance de l’environnement Windows
• Il est souhaitable que l’apprenant ait des connaissances sur les différentes analyses statistiques mises en œuvre au cours de cette formation.

Programme

Comprendre les principes généraux du langage R
• Bref historique
• Fonctionnement général de R
• Fonctionnalités, avantages, inconvénients
• Installation de R
• Site du projet R et documentation
Se repérer dans l’interface du logiciel R et maîtriser les notions élémentaires
• Interface et gestion des fenêtres
• Utiliser la console R
• Organiser un projet R
• Saisir et rappeler des lignes de commandes
• Obtenir de l’aide en ligne
• Mode console, mode script
• Choisir le répertoire de travail
• Affecter des objets (créer des variables)
• Lister et effacer les objets en mémoire
• Sauver/charger l’environnement de travail et l’historique des commandes
Créer et manipuler des objets sous R
• Attributs intrinsèques des objets
• Création et indexation des vecteurs (variables quantitatives)
• Opérations sur les vecteurs
• Extraction des éléments d’un vecteur
• Création et manipulation des facteurs (variables qualitatives)
• Création d’un tableau de données (data frame)
• Extraction des éléments d’un tableau de données
• Extraction des éléments d’une sortie R
Réaliser un calcul arithmétique et utiliser les fonctions simples
• Opérateurs arithmétiques (+, -, *, /)
• Fonctions mathématiques de base sur les données : log, exp, sum, mean…
Connaitre et utiliser les opérateurs de comparaisons
• Opérateurs de comparaisons
• Extraction des éléments d’un vecteur par conditions
• Filtrage des données
 
Importer des données
• Contenues dans un fichier ASCII
• Contenues dans une feuille de calcul Excel
• Contenues dans le presse-papiers
Créer et exécuter des scripts
• Lecture
• Ecriture
• Exécution et débogage
• Ouverture sur la création de fonctions utilisateur simples
Créer et manipuler des graphiques
• Les fonctions graphiques : plot, hist, boxplot, stripchart…
• Gestion des graphiques
 Ouverture de plusieurs fenêtres graphiques
 Partitionnement des graphiques
• Les fonctions graphiques secondaires : points, lines, abline, title, legend…
• Les commandes de mise en forme des graphiques
• Le paramétrage des graphiques
Mettre en œuvre des analyses statistiques de base sous R
• Analyse descriptive des données
 La description par le chiffre : commandes summary, sd, table…
 La description par le graphique
• Identification des valeurs suspectes
• Intervalle de confiance d’une moyenne
• Tests d’hypothèses paramétriques et non paramétriques
 Comparaison des moyennes (Student)
 Comparaison des médianes (Wilcoxon, Mann-Whitney)
 Comparaison des variances (Fisher)
 Comparaison des proportions (χ², Fisher exact)
 Test de Normalité (Shapiro-Wilk)
• Analyse de la variance à 1 facteur et tests post-ANOVA (comparaisons multiples)
• Régression linéaire simple
• Utilisation des interfaces du type Rcmdr

Méthodes pédagogiques

Les notions abordées sur le logiciel R seront mises en pratique sur des exemples simples et pédagogiques. La mise en œuvre d’analyses statistiques de base sera abordée (Statistiques descriptives, tests d’hypothèses paramétriques et non paramétriques, ANOVA à 1 facteur, régression linéaire simple…)